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Nature 2026-06-25｜本週新刊導讀

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標籤2

本期共 62 篇，其中 19 篇 OA。

本期主軸

本期最鮮明的主線，是「工具能力提升後，判斷力是否同步提升」。AI 已能進行程式搜尋、數學推理、影像處理與推薦排序，但成果高度取決於評分函數、資料環境與制度誘因；產出速度、排行榜表現或模型複雜度，不能直接等同科學原創性、因果理解或公共價值。

生命科學部分集中於「空間與狀態」：腫瘤並非單一細胞群，而是由癌細胞、免疫與基質細胞形成可重複辨識的 ecotype；神經元遷移、白質損傷、GLP1R reward circuit 與 postprandial T-cell metabolism，則顯示短暫的空間、機械或營養條件，可能留下持久的生物效應。

第三條主線是轉型的隱藏代價。能源轉型所需礦產可能帶來遠超礦坑本身的森林損失；AI 基礎建設受限於電力、水與語言多樣性；農業育種也不能只追求產量，而必須同時處理 micronutrient density、氣候韌性與監管可行性。

必讀導讀

An AI system to help scientists write expert-level empirical software — OA · benchmark study

ERA 將科學程式開發改寫成可評分的搜尋問題：以 LLM 進行語意層級的程式改寫，再用 tree search 反覆選擇高分方案。系統在 single-cell batch integration 找到 40 種超越原排行榜最佳方法的新方案，並產生 14 個優於 CDC ensemble 的 COVID-19 住院預測模型，也跨足地理空間、神經活動與數值計算。真正的突破是把「閱讀方法、實作、評估、再組合」納入同一自動循環；限制則同樣明確：最佳化可量化指標不代表已建立理論、辨識因果或提出正確科學問題，且評分函數不完整時可能出現 metric gaming。

常見誤判：把 leaderboard 上較高的預測分數，視為 AI 已經完成自主科學發現。

Spinal neuromotor rehabilitation using a portable isokinetic training robot — pilot trial

僅依摘要評論。研究以僅重 0.96 kg 的穿戴式機器人，對 n=6 名 SMA type II 兒童與青少年進行 6 週 isokinetic resistance training。摘要報告 sit-to-stand 起始膝屈曲角改善 7°，peak torque、ROM 與 work 分別增加 130%、51% 與 97%，並伴隨 quadriceps hypertrophy 與 CMAP 增加；部分效果在停止機器人訓練後仍保留。這是支持「短期阻力訓練可能誘發撤除裝置後仍存在的 neuromuscular adaptation」的重要訊號，但樣本極小、缺乏對照組，尚不能排除成熟、復健共介入、學習效應與回歸平均值。

常見誤判：把小型前後比較當成已證實療效，或將裝置即時輔助誤認為持久神經肌肉恢復。

Mining triggers extensive additional deforestation in sub-Saharan Africa — OA · observational

研究整合 2001–2020 年 16,627 座礦場，以 difference-in-differences 估計採礦前後的森林變化。直接礦業設施造成約 187,000 公頃森林消失；但礦場 1 公里內的額外森林砍伐增加 8.0 個百分點，影響在 20 公里外及十年後仍可觀察。平均每 1 公頃直接損失，五年內另伴隨約 34 公頃 offsite loss，可能來自道路、聚落與農業擴張。這使 environmental impact assessment 的邊界必須由「礦坑面積」擴展至供應鏈與周邊土地利用；不過，能連結至特定礦產的礦場不到一成，商品別推論仍有限。

常見誤判：只計算礦坑與尾礦池面積，便認為已涵蓋採礦的完整森林足跡。

Systematic partisan content skews in TikTok during the 2024 US elections — OA · audit study

研究建立 323 組受控 sock-puppet audits，在三州、27 週內收集逾 280,000 次推薦。Republican-seeded 帳號收到的同黨派內容比 Democratic-seeded 帳號多約 11.5%；後者接觸跨黨派內容則多約 7.5%，其中相當部分是反 Democratic 訊息。由於帳號互動程序被標準化，結果顯示單靠可見 engagement 難以解釋差異；但研究無法完全拆分推薦演算法、平台既有內容供給與創作者網絡的作用，且僅分析英文、年輕帳號與初期使用階段。這是 exposure audit，不是投票行為研究。

常見誤判：把推薦內容的不對稱，直接解讀為平台刻意支持特定政黨，或已證明其改變選舉結果。

A brain reward circuit inhibited by next-generation weight-loss drugs in mice — OA · animal study

研究以 humanized GLP1R 小鼠處理小分子 GLP1RA 對齧齒類受體結合不足的問題，辨識出 central amygdala 的特定 GLP1R neurons。此細胞群可降低 nucleus accumbens dopamine release，選擇性抑制 palatable food 的 reward-driven intake；刪除該群細胞的受體，會削弱藥物對享樂性進食的抑制，但不等同全面消除 homeostatic anorectic effect。結果將 GLP1RA 的作用由 hypothalamus、hindbrain 延伸至 reward circuit，也提出 binge eating 與 substance-use disorder 的研究方向；目前仍屬小鼠機轉，不足以支持人類適應症外處方。

常見誤判：由小鼠 reward-circuit 結果推定所有 GLP1RA 已能治療成癮或 binge eating。

Non-invasive profiling of the tumour microenvironment with spatial ecotypes — OA · translational

研究整合超過一千萬個 single-cell 與 spatial transcriptomic observations，建立 Spatial EcoTyper，辨識九種跨癌別保留、具有不同空間位置與臨床關聯的 spatial ecotypes。更具轉譯性的步驟，是以 DNA methylation 與 Liquid EcoTyper 從 plasma cfDNA 回推這些 TME 結構；在近 100 名 melanoma 患者中，推得的 ecotype level 與 immune-checkpoint inhibitor response 呈明顯關聯。這提供「液態切片讀取多細胞空間生態」的可能性，但目前是 exploratory association；analytical sensitivity、specificity、治療造成的背景訊號與跨癌別可泛化性，仍需大型前瞻性驗證。

常見誤判：把 cfDNA 推估的 ecotype 當成直接觀察到的組織空間結構，或視為已核准的預測 biomarker。

Ecotypes of triple-negative breast cancer in response to chemotherapy — OA · observational

研究分析 101 名未治療 TNBC 患者的 427,857 個細胞，另有 44 名接受 spatial transcriptomics；作者辨識四種 cancer-cell archetypes、13 種 metaprograms、49 種 immune/stromal states 與八種 ecotypes。值得注意的是，與 neoadjuvant chemotherapy response 關聯最穩定的訊號不只來自 T cells：八種 macrophage states 中有七種在 pCR 與 residual disease 間不同，並與 interferon、angiogenesis、ECM remodelling 等癌細胞程式共同出現。13-gene panel 與 cell-state classifier 具轉譯潛力，後者報告 AUC=0.883，但仍須 prospectively validate，且現行 early TNBC 的 chemo-immunotherapy 情境尚未充分涵蓋。

常見誤判：將 macrophage subtype 與 pCR 的關聯講成已證實的致效機轉，或立即用研究型 panel 決定治療。

Confined migration induces non-lethal DNA damage in developing neurons — OA · mechanistic

研究顯示，發育中的 cerebral 與 cerebellar neurons 穿越狹窄間隙時，機械應力會造成大量 DNA double-strand breaks；其來源涉及 topoisomerase-IIβ covalent complexes，卻沒有多數癌細胞遷移時常見的 nuclear-envelope rupture。正常情況下，損傷由 non-homologous end joining 修復且不致細胞死亡；在神經元遷移開始時刪除 ligase IV，則會累積持久 DSB、出現部分突觸與發育基因變化，以及晚期輕度運動缺陷。研究建立的是生理遷移與 genome maintenance 的機械連結，與人類 neurodevelopmental disease 的關係仍屬假說。

常見誤判：認為正常發育期間出現 DNA damage 就必然造成神經退化、癌變或明顯功能障礙。

指南／綜論／方法學（表格）

本期無正式 guideline；以下先列綜論與方法論，再按文章性質納入其餘內容。

綜論與研究方法

文章類型導讀重點
Make science more reliable: study people as they go about their livesmethodologyNatural field experiment 可減少受試者自我選擇與被觀察後改變行為的偏差，但不能自動解決族群外推問題；低風險、必要性、去識別與群體層級傷害仍須由 IRB 審查。
Genetic technologies to enhance crop nutritional value under climate changenarrative review僅依摘要評論。主張作物改良必須同時處理產量、multi-biofortification 與氣候韌性；CRISPR–Cas 不宜單打獨鬥，應與 metabolic engineering、pangenome 與傳統育種整合。
Immunological mechanisms of mRNA vaccines for infectious diseasesnarrative review僅依摘要評論。整理 mRNA、nucleoside modification 與 LNP 如何協調 innate/adaptive immunity，並指出 LNP sensing、adjuvant pathway 及 immunogenicity 與 reactogenicity 能否分離仍是關鍵缺口。

社論、觀點與書評

文章類型導讀重點
Europe must seize the moment to lead on free and open scienceeditorial歐洲具跨國資助、國際合作與開放科學優勢，但創新商業化與企業 R&D 偏弱；若要成為全球科學樞紐，仍須在學術自由、科研流動及 dual-use research 間建立制度界線。
‘Us’ not ‘them’: scientists must use their skills to help stop polarization and divisioneditorial社區層級、貼近日常利益的議題框架，可能降低抽象意識形態對政策態度的預測力；但自陳態度不等於實際行為，去極化介入仍需跨地區重複驗證。
Will AI spark a scientific renaissance — or a diffuse monoculture?World ViewAI 可縮短跨領域知識轉譯，也可能讓相同資料集、pipeline 與論述模板大量複製；評鑑若只獎勵速度、技術規模與引用，會造成題目多元但推理方式單一的「diffuse monoculture」。
Silicon Valley’s vision for global AI is flawed: each country needs its own blueprintWorld View以充足電力、水、資本與英文 benchmark 為前提的 scaling strategy，未必適合多語、mobile-first 且基礎建設受限的國家；AI sovereignty 應優先回答本地公共服務需求，而非複製最大模型。
Why heritage sites are at risk in a warming world — and how to save thembook review氣候調適迫使文化保存由「材料永久不變」轉向 transformation、digitization 與 reconstruction；真正困難的是由誰決定何者保留，以及不可貨幣化的場所、記憶與無形文化如何納入 loss and damage。
Why science needs the humanities more than evercommentaryAI、biotechnology 與 surveillance 所衍生的權力、倫理與不平等問題，不能只靠技術最佳化處理；人文教育的角色不是 STEM 的裝飾，而是訓練歷史判斷、倫理推理與制度反思。

Research Highlights、新聞與專題

文章類型導讀重點
The brain region that could provide a cognitive ‘reservoir’ in old ageresearch news特定 cerebellar regions 的較大組織體積與較佳認知測驗表現相關，提示 cerebellum 可能參與 cognitive reserve；目前是結構與表現的 association，不能推論增加體積可預防失智。
Fiery data hint that controlled forest fires benefit human healthresearch newsCalifornia 分析顯示 prescribed burning 雖造成短期煙霧，可能藉減少後續大型 wildfire 而降低長期污染暴露；淨健康效益仍取決於地點、氣象、燃燒規模與暴露族群。
Clues to the sloth’s sloth found in its genomeresearch newsCholoepus didactylus genome 出現與 mitochondria 有關的基因重複，可能協助理解低代謝與緩慢活動的演化；基因 copy-number 線索仍需功能實驗，不能單獨證明表型來源。
It slices! It dices! Sashimi-Bot handles seafood with easeresearch news三臂機器人能固定、切割並以筷子擺放形狀不規則且柔軟的 salmon loin，展示 deformable-object manipulation 的進展；實驗成功不等於已符合餐飲業速度、衛生與成本要求。
Humans outperform AI at this highly rigorous mathematics testnewsFirst Proof 以未公開、研究層級題目及數學家盲評降低 training-data contamination；最佳 harness 解出十題中的六題，仍常缺最後關鍵構想、細節閉合與文獻引用。
Oceans in Asia smash heat records — what it means for extreme weathernews2025 年亞洲海洋熱含量與海平面創高，海洋 heatwave、La Niña／El Niño 轉換與暖化背景疊加，使 drought、wildfire、暴雨與 cyclone 風險更難以單一氣候指標概括。
At-home brain implant gives man with motor neuron disease his daily life backnews一名 ALS 受試者近兩年在家使用 speech BCI，平均達每分鐘 56 字，亦能控制游標；長期穩定與生活效益突出，但仍是單一個案，侵入性、維護與疾病進展須持續評估。
How the brain builds sentences, neuron by neuronnewsepilepsy monitoring 提供單神經元層級資料，顯示部分細胞偏好 encoding syntax、semantics 或詞類，並參照前數個詞的脈絡；短期紀錄尚無法判定這些表徵是否長期穩定。
The latest benefit of obesity drugs: boosting testosterone and sperm qualitynews小型研究與初步 systematic review 顯示，肥胖合併 hypogonadism 者使用 GLP-1 drugs 後 testosterone 或 sperm parameters 可能改善；證據量少，且效應可能主要由減重與代謝改善介導。
Brexit tore apart European science — now the research rifts are healingnews英國重返 Horizon Europe 後，EU grant share 已回升，但領導 consortium、研究人員自由移動與長期信任較難迅速重建；資金流恢復不代表合作網絡已回到 Brexit 前狀態。
This World Cup could be the most high-tech yet — the innovations to watch forQ&AAI tracking、3D avatar、smart ball 與即時 match analytics 將廣泛部署；真正瓶頸不是資料不足，而是 staff 能否正確解讀，以及現有 injury-risk models 是否經過足夠驗證。
Europe as science superpower: what it will take to rival the US and Chinanews feature歐洲的文章產量、國際合作與公共研究實力可與美中競爭，但企業 R&D、venture capital 與市場整合不足；吸引人才的短期方案不能取代薪資、跨境制度與創新規模化改革。

Correspondence 與職涯

文章類型導讀重點
The halo effect: how academic hierarchy undermines peer review and enables fraudcorrespondence作者指出研究不端往往由外部資料偵探揭露，反映機構與同儕審查可能受名望階序影響；改革重點應是可檢核資料、獨立調查及避免以資歷取代證據審查。
Nepal’s new science ministry must strengthen scientific capacitycorrespondence尼泊爾首度成立獨立科學、科技與創新部，機會在於建立長期資助、研究職涯與基礎設施；若只增加行政層級而未處理人才外流與執行能力，象徵意義將大於實效。
Academic success still assumes uninterrupted careerscorrespondence以連續產出、固定年限與線性升遷衡量學術成就，會系統性懲罰 maternity leave、照護與臨床工作；評鑑應按實際 active research time 校正，而非只提供形式上的期限展延。
Do not leave fungi out of impact assessmentscorrespondence巴西首份受威脅真菌名錄僅涵蓋已知物種約 0.3%，凸顯環評偏重動植物的盲點；真菌調查、標本典藏與 taxonomic capacity 應成為開發評估的常規項目。
My diverse academic background is affecting my PhD studies — what do I do?career Q&A跨 applied physics、chemical engineering 與 physical geography 並非必然劣勢；第一年應先補核心知識，與指導教授界定小型可完成題目，再把舊技能當方法資產而非研究主題本身。
My overseas job offer was rescinded. Here’s how I bounced backcareer essay海外職缺在離開 tenure 後撤回，凸顯 tentative offer 與正式契約的差距；作者以 consultancy、teaching、地方氣候行動與合作寫作重建職涯，但其經驗也受家庭經濟支持條件影響。

News & Views

文章類型導讀重點
A vast whale necropolis has been foundcommentary僅依摘要評論。約 1,200 公里長、深達 7 公里的 Diamantina Zone 同時保存現代 whale falls 與數百件化石，形成研究深海食腐生態及 cetacean evolution 的長時序檔案。
Light slows down carbon nanotubes in watercommentary僅依摘要評論。光激發後 carbon nanotube 在水中的擴散變慢，支持 exciton 與水分子模態直接交換動量的 quantum-friction 解釋，並為可光控的 nanoscale transport 提供實驗入口。
Navigating a crowded developing brain leaves neurons with broken DNAcommentary僅依摘要評論。評論指出神經元遷移的機械壓迫會造成 DSB，而正常發育仰賴及時修復；其臨床意義在於 DNA-repair defects 可能將常態生理負荷轉化為晚期功能缺損。
Forty years of high-temperature superconductivitycommentary僅依摘要評論。回顧 cuprate 在 35 K 的突破如何改寫材料搜尋，也提醒「high-temperature」仍遠低於室溫；四十年後，配對機制、pseudogap 與實用條件仍未完全統一。
How a rush for minerals is causing deforestation in tropical regionscommentary僅依摘要評論。評論強調以 difference-in-differences 估計礦場周邊反事實森林變化，優於只畫礦坑面積；政策上應把道路、聚落與農業擴張納入 critical-mineral footprint。

其他研究與技術進展

文章類型導讀重點
Visualizing the impact of quenched disorder on 2D electron Wigner solidsquantum study僅依摘要評論。STM 結合 neural-quantum-state QMC，分辨 long-range 與 short-range disorder 對 Wigner solid 的不同作用，並觀察 mixed solid–liquid、局部再入熔融及 amorphous phase。
Optical metasurfaces for general vision processing on the edgeoptical computing僅依摘要評論。以 4,100 萬參數 metasurface 前端搭配 87,000 參數數位後端，處理 detection、segmentation、3D reconstruction 與 video；仍須比較製造容差及端到端能耗。
Chiral laser gyroscopes breaking the lock-in limitOA · photonics利用 spontaneous chiral symmetry breaking 與 nonlinear frequency pulling，在未加入外部元件下解除低轉速 lock-in；近零轉速仍呈線性反應，bias instability 達 2.2×10^-2 degree/hour。
Light-induced quantum friction of carbon nanotubes in waterOA · nanophysics光激發使水中 functionalized SWCNT diffusion constant 線性下降約 50%；缺陷使 exciton localization 後效應消失，THz spectroscopy 與 simulation 共同支持 exciton–water coupling。
Cucurbituril-based anion-conducting membranes with supramolecular nanoporesmembrane study僅依摘要評論。cucurbit[7]uril 與陽離子 polymer 的動態 host–guest network 形成均一 nanopores，利用 picosecond fluctuation 促進 hydroxide 的 Grotthuss transport，兼顧導電與機械穩定性。
Crude oil fractionation by means of mesoporous polyacrylonitrile membranesprocess study僅依摘要評論。重質烴在 PAN mesopores 內形成自限性沉積，將孔徑縮至 sub-2-nm 並選擇性富集較輕餾分；模擬估計可降低能源 31.6%、CO₂ 排放 37.6%。
Amplified Arctic iceberg traffic reshapes benthic biodiversityOA · observationalFram Strait 的 dropstones 與數十年航行紀錄顯示，glacier destabilization 及較動態的 sea ice 可能增加長距離 iceberg transport，既重塑 benthic hard-bottom habitat，也提高航行風險。
A 5.3-million-year-old deep-sea whale necropolis in the Diamantina ZoneOA · palaeoecology在 4,616–7,001 公尺深處記錄五個現代 whale-fall communities 與 476 件 cetacean fossils，isotopic dating 顯示此沉積至少延續 530 萬年，構成罕見的深海演化檔案。
Demography and life histories across the Roman frontier in Germany 400–700 ceOA · ancient DNA258 個 ancient genomes 顯示羅馬政權崩解後由小群體移動、跨族通婚與持續 admixture 共同塑造人口；pedigree reconstruction 亦提示 nuclear family、monogamy 與嚴格避免近親婚。
Genetic architecture of sugarcane traits in a polyploid genomics frameworkOA · genomics完整分相 POJ2878 的 118 條 chromosomes，並以 981 份 germplasm 追蹤育種 haplotypes；研究連結 SUS2、SUT2 等位型與 sucrose storage，提供 polyploid GWAS 的方法基礎。
The neural mechanisms supporting the rise and fall of maternal aggressionOA · animal study小鼠研究定位 PAEsr1–VMHvlNpy2r circuit：哺乳期 synaptic potentiation、神經元興奮性與 oxytocin drive 共同提高 maternal aggression，幼鼠移除後訊號下降則使攻擊行為迅速消退。
An enteric neuron ionotropic receptor regulates salt stress resistanceOA · mechanisticC. elegans I3 enteric neuron 以 GLR-9／GLR-7 感知腸腔 cations；急性 stress 依賴 cholinergic signalling，acclimatization 則依賴 peptidergic signalling，並調控遠端組織反應基因。
Focal white matter lesions drive grey matter inflammation and synapse lossOA · animal studyfocal white-matter lesion 可暫時引發 grey-matter microgliosis、synapse loss 與 engulfment；完整 remyelination 後可逆轉，反之則轉為慢性發炎，顯示短期 microglial response 未必純屬有害。
HIV-1 signalling remodels nuclear pores to licence infectionOA · mechanisticHIV-1 cell–cell spread 觸發 CD4–LCK–CDK1 signalling，磷酸化 nucleoporins 並促進 capsid nuclear import；這可解釋 resting CD4 T cells 在體內可感染、cell-free virus 在體外卻效率低。
Postprandial lipid metabolism durably enhances T cell immunityOA · translationalfed state 的 chylomicrons 可經 mTORC1 重新設定 T-cell metabolism，效應在 activation 與 expansion 後仍存在；同一 donor 的 postprandial CAR-T 表現較佳，但尚未形成採血或製造標準。
Large-scale discovery, analysis and design of protein energy landscapesOA · methods study以 multiplexed intact-protein hydrogen–deuterium exchange 分析 5,778 個短 protein domains，量測 native structure 以外的高能態波動，並據此設計可穩定局部 secondary structures 的 mutations。

Matters Arising 與 Corrections

文章類型導讀重點
On the robustness of topological gap detection via transportmatters arising僅依可見聲明評論。作者重析 Microsoft Azure Quantum 的 transport data，認為 parity readout 所在參數區域可能高度 disorder 且 gapless，因此訊號或可由 trivial mechanism 解釋。
Reply to: On the robustness of topological gap detection via transportmatters arising僅依可見聲明評論。原團隊回應其 quantum-capacitance 判讀並不預設存在 gap，且穩定的 h/2e periodic bimodal signal 難由 gapless system 維持；爭議核心是 transport 與 interferometry 的證據權重。
Author Correction: Physiology and immunology of a pig-to-human decedent kidney xenotransplantcorrection修正 Extended Data Fig. 8e 的免疫細胞族群頻率，以及 Fig. 8f 中 hCD45 由 48% 更正為 0.48%；幅度差異大，引用原文免疫表型時應確認版本。
Author Correction: A broadly protective antibody targeting gammaherpesvirus gBcorrectionExtended Data Fig. 3a 的 kidney source data 誤用另一資料集，現已同步修正圖表與原始資料；此類錯誤不宜只視為排版問題，後續 secondary analysis 應重新下載資料。
Author Correction: De novo design of quasisymmetric two-component protein cagescorrection更正共同作者 David Chmielewski 的姓氏拼寫；不涉及實驗結果或結論，但會影響作者索引、引用追蹤與學術紀錄歸屬。
Author Correction: PTC-bearing mRNA elicits a genetic compensation response via Upf3a and COMPASS componentscorrectionExtended Data Fig. 1l 的 y 軸上限由 2,000 更正為 1,500 pixels；因原文年代較久，以補充檔提供修正版，使用該圖定量時須引用 amendment。

臨床可帶走的 10 點

  1. 穿戴式阻力訓練機器人的小型 SMA 研究屬 proof of concept，尚不足以改變標準復健路徑。
  2. GLP-1 drugs 對 testosterone 或 sperm quality 的證據仍初步；備孕者不應把觀察訊號視為核准適應症。
  3. 小分子 GLP1RA 影響 reward circuit 的證據來自 humanized-receptor mice，不能直接外推成癮治療效果。
  4. 居家 speech BCI 的長期功能性令人重視，但目前仍須逐案評估侵入風險、設備照護與訊號衰退。
  5. mRNA–LNP vaccine 的 immunogenicity 與 reactogenicity 能否可靠分離，仍是下一代平台的核心問題。
  6. 採血時的 fed／fasted state 可能影響 T-cell metabolic phenotype；研究採樣與 cell-therapy 製造應至少記錄營養狀態。
  7. cfDNA 推估 TME ecotype 是 promising liquid biopsy strategy，但尚未取代 tissue profiling 或既有 ICI biomarkers。
  8. TNBC chemotherapy response 可能取決於癌細胞、macrophages 與其他 TME states 的組合，而非單一 immune-cell marker。
  9. 暫時性 microgliosis 可能是 remyelination 的必要環節；治療目標不宜不分時相地全面壓制 microglial activation。
  10. Cerebellar volume、認知表現與老化間目前是 association，不能據此宣稱特定訓練可增加「認知儲備組織」。

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社論、觀點與綜論

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